Genom-und Plasmidsequenzierung
Ziel dises Projektes ist die Aufklärung der Genomsequenz eines Lactobacillus buchneri-Stammes. Außerdem werden wir verschiedene Plasmide sequenzieren, um neue “origins of replication” zu entdecken. Diese können dann zur Konstruktion von Expressions- und Integrationsvektoren verwendet werden.
Diplomarbeit zu vergeben!
“Whole Genome Sequencing” stellt heutzutage die Grundlage für jeden rationalen Ansatz zur Stammverbesserung von Mikroorganismen dar. Unser Zielorganismus ist in erster Linie Lactobacillus buchneri. L. buchneri schützt Silagen selbst unter aeoroben Bedingungen durch die Bildung von Essigsäure und 1,2-Propandiol vor Befall durch Schadorganismen (Holzer et al., 2003). Um die genetische Basis der zugrundeliegenden Stoffwechselwege und deren Regulation aufzuklären wurde, in zusammenarbeit mit dem CeBiTec in Bielefeld, das gesamte Genom eines L. buchneri Stammes sequenziert. Die Kenntnis der Genomsequenz und des metabolischen Netzwerkes können jetzt zur gezielten Verbesserung der Eigenschaften unseres L. buchneri Stammes verwendet werden. Zusätzlich werden wir Plasmide verschiedener anderer Milchsäurebakterien sequenzieren, mit dem Ziel, neue “origins of replication” zu identifizieren. Diese können dann zur Konstruktion neuer Expressionsvektoren verwendet werden.